次世代シーケンサーの進化に伴い、普及が進むゲノム解析。一方、課題もある。ゲノムデータを演算処理する計算時間だ。次世代シーケンサーの読み取りが早くなっても、演算処理に時間がかかっていた。

ミタテゼプトテクニカ（ＭＺＴ、東京都渋谷区）はこの課題解決を目指すスタートアップだ。日本の半導体会社からエンジニアが集まり、設立した。原島圭介社長は「ゲノム診断をレントゲン並みに身近にする」と力を込める。

コストは低下も、計算に課題

２０００年にほぼ完了したヒトゲノム計画以降、ゲノム解析のコストは低下を続けてきた。２０００年ごろは約１００億円以上かかっていた解析コストは、現在約１０万円程度まで低下してきた。ここに貢献したのが次世代シーケンサーの進化だ。多くのゲノムデータを処理できるようになり、コストが下がってきた。

課題もある。次世代シーケンサーではゲノムデータをぶつ切りにして処理をする1次解析と、それらをつなぎ合わせる2次解析を経る。この２次解析に時間がかかっている。ＭＺＴはゲノム解析向けのＡＳＩＣ（特定用途向け集積回路）を開発。膨大なゲノムデータを最適に処理するアルゴリズムと組み合わせ、解析時間を５分以内まで縮める。同社は解析速度の向上により、対応できる患者数が増えればゲノム解析のコストも低下するとにらむ。ＡＳＩＣを採用することで低消費電力も狙う。１６個のチップを一つのアクセラレータとして使う。導入費用は米イルミナの製品よりも１０分の１程度の２００万円台での提供を目指す。

２４年の販売を目指す

２４年ごろの販売を目指す。同社は同時期に次世代シーケンサーが２万台程度普及すると予想する。次世代シーケンサーの１．５倍から３倍の解析機器が必要だと試算。同社はそこで１割程度のシェアの獲得し、２００億円規模の売り上げを目指す。

原島社長は「米エヌビディアをロールモデルにしたい」と話す。ＧＰＵ（画像処理半導体）が祖業のエヌビディアは、人工知能（ＡＩ）開発を支援するソフトウエアを手がけるなど、半導体販売の事業モデルを変化させてきた。ＭＺＴもゲノム解析用半導体の販売から事業を広げ、ゲノム応用ソフトウエア事業への展開も視野に入れる。